Результатом был раскол. Несколько месяцев в ордене шли жаркие диспуты о пределах папской власти, и был даже выбран антимагистр Ростан, который, видимо, был Главным командором в 1162 г. Король Амори попытался примирить противоборствующие стороны в ордене, и, может быть, тем самым он надеялся навязать им свою власть. Понс Бланус и новый Главный командор были вызваны к королю. Понс повторил, что он намерен обратиться в Рим, но Главный командор запретил ему это делать, мотивируя это тем, что такой поступок противоречит обычаям госпитальеров. Понс потребовал, чтобы Капитул рассмотрел это дело и вынес свое решение. Главный командор приказал ему, согласно законам ордена, прежде чем отправиться в Европу, сложить свое оружие и передать ему своего скакуна, но снова запретил ему уезжать. Ситуация еще более осложнилась, потому что Жильбер д’Эссайи, прослышав о хаосе, что последовал за его отставкой, и усомнившись в законности своих действий, постарался вернуться к исполнению своих обязанностей. Его убедили принять участие в ассамблее, проводившейся в Иерусалиме, на которой было решено представить вопрос на рассмотрение папы, и он отправился в Рим, чтобы оправдаться перед папой. Папа Александр III наложил запрет на дальнейшие диспуты, из которых никто не извлек для себя пользы. Папа подтвердил отставку Жильбера и избрание Гастона и ратифицировал документ об ограничении властных полномочий будущих магистров. Жильбер больше не вернулся в Святую землю, и его жизнь окончилась трагически. Он отправился в Англию для встречи с королем Генрихом II, и корабль, на котором он плыл, отойдя на три мили от Дьепа, затонул в Ла-Манше.

Гастон де Мюрель был родом из Оверни, пользовался хорошей репутацией, будучи честным, скромным и добрым. Он был казначеем в ордене, но, вероятно, в едва не наступившем банкротстве ордена в 1179 г. не было его вины. Видимо, братья надеялись, что он сможет восстановить финансовое положение; и, может быть, в том, что этого удалось достичь к концу его правления, была и его заслуга. Однако правление Гастона де Мюреля было коротким, и он умер 20 июня 1172 г.

Ему наследовал Жобер, человек мирный по своему характеру, отнюдь не воин, на что указывают изданные им статуты о попечительстве над пилигримами и церковном служении. Было высказано предположение, что его избрание продемонстрировало реакцию на политику милитаризации ордена, проводившуюся Жильбером. В действительности имеется недостаточно свидетельств этого, и следует подчеркнуть, что его преемник Роже де Мулен, который был именно воином, также был обязан следовать положениям Устава Госпиталя. При Жобере орден продолжал свою политику в военной сфере.

Жобер умер в 1177 г., и состоялось избрание Роже де Мулена Великим магистром. Мало что известно о прошлом Роже, как и о прошлом других магистров XII в. В 1175 г. он был рядовым братом в Антиохии, но неизвестно, занимал ли он какой-либо пост. Однако его можно рассматривать как одного из самых значимых магистров. При его правлении госпитальеры начали играть важную роль во внутренней политике Латинской Сирии. Известно, что он дважды побывал в Европе. В 1179 г. он посетил Сицилию, а в 1184 г. он сопровождал патриарха и Великого магистра ордена тамплиеров в поездке по Европе с целью получить помощь для Латинской Сирии. Возможно, что в связи с визитом к папе во время этого последнего путешествия он получил от Святого престола несколько булл, которые значительно укрепили положение Госпиталя как самостоятельного ордена.

Когда Роже вернулся на Восток, он оказался в центре самой серьезной междоусобной борьбы, какую когда-либо знало Иерусалимское королевство. Он погиб, пытаясь разрешить возникшие противоречия, за которые он сам отчасти нес ответственность. В апреле 1187 г. короля Ги де Лузиньяна убедили начать переговоры с графом Триполийским Раймундом, который был против коронации Лу-зиньяна и намеревался сам стать королем. Балиан Ибелин, архиепископ Тира Йоския, магистр тамплиеров Жерар де Ридфор и Роже де Мулен были посланцами Лузиньяна к Раймунду. 29 апреля они выехали из Иерусалима, сопровождаемые десятью госпитальерами. На следующий день оба магистра и архиепископ поехали вперед, оставив Балиана в Неаполисе (Наблусе). Вечером 30 апреля они достигли замка Ла-Фев, где их ждало послание от Раймунда, предупреждавшее их, что они должны остаться в замке, поскольку в соответствии с договором, который он подписал с Саладином, он, Раймунд, позволил разведывательному мусульманскому отряду вступить в пределы Палестины, пройдя через фьеф своей жены в Галилее.

Жерар де Ридфор сразу призвал к себе своего маршала Жаклена де Майи, находившегося поблизости с 80 конными рыцарями. На следующий день небольшое войско христиан пополнилось 40 простыми рыцарями из Назарета. Вблизи Сепфориса у источников Крессон они встретились с 7-тысячным мусульманским войском. И Роже де Мулен, и Жаклен де Майи не советовали атаковать превосходящие силы противника, но Жерар де Ридфор, человек горячий и бесшабашный, обвинил маршала и Роже в трусости. Небольшой отряд устремился в безнадежную атаку. Роже де Мулен и Жаклен де Майи пали бок о бок. Удалось бежать только трем тамплиерам, одним из них был магистр, который впоследствии пережил позор катастрофы еще большей, чем при Сепфорисе. Смерть Роже де Мулена была тяжелым ударом для королевства; не в последнюю очередь потому, что не стало одного из советников короля, чье мнение уравновешивало поспешные решения де Ридфора и других придворных. К тому же орден остался без вождя в опасное и трудное время. Для хрониста с далекого севера Европы аббата Арнольда Лю-бекского Роже был также вождем всех христиан. Для известного мусульманского историка Ибн аль-Атира он был «одним из наиболее прославленных христианских деятелей среди франков, который питал великую ненависть к мусульманам».

Во время правления этих пяти магистров, в период между 1160 и 1187 гг., Госпиталь продолжал накапливать свои богатства и получать новые привилегии. Это были годы, в которые он снискал наибольшую известность среди паломников в Иерусалиме. К XIII столетию более значимой стала военная составляющая ордена, а благотворительная деятельность стала второстепенной. И странноприимный дом ордена в Акре уже не имел прежней славы. А еще совсем недавно в Иерусалиме на попечении госпитальеров находилось до 2 тысяч немощных мужчин и женщин, и после сражения при Монжизаре в 1179 г. братья приняли для излечения 750 раненых.

Основным направлением деятельности ордена стала подготовка воинов и участие в политике Иерусалимского королевства. В Латинской Сирии магистры продолжили практику Раймона дю Пюи приобретения на выгодных условиях новых земель, для защиты которых требовалась военная сила. В 1168 г. орден получил права на еще незавоеванные земли в Египте, о чем будет сказано ниже. В том же году князь Антиохии Боэмунд III даровал госпитальерам значительный участок земли, который включал Апамею и большую часть правого берега реки Оронт. Большинством этих земель владели сарацины, а Апамея была оккупирована мусульманами с 1149 г. Как и графы Триполи в 1144 г., князья Антиохии передавали ордену часть своих обязанностей по охране границ на очень выгодных условиях, надеясь в то же время, что ордену удастся возвратить хотя бы часть земель, которые они потеряли. Боэмунд передал эти земли госпитальерам на правах вассалитета. Они получили полную свободу вести войны против сарацин и заключать с ними договоры, и Боэмунд обещал, что и он, и его люди окажут им поддержку. Сам он дал обязательство не заключать договор ни с мусульманами, ни с теми христианами, которые были им союзниками, не посоветовавшись прежде с братьями. В случае если он заключит договор, госпитальеры не обязаны ему следовать. Они получают все трофеи, захваченные ими, и князь не имеет права требовать даже часть их.