Благодаря своей исключительной работоспособности и исполнительности Косыгин постепенно, но неуклонно восстанавливал свои аппаратные и политические позиции при Хрущёве, который первоначально относился к нему с большим предубеждением. В 1955 году Алексей Николаевич снова член Президиума Совмина СССР. В 1957 году Косыгин снова становится кандидатом в члены Президиума ЦК (Политбюро) и первым замом Председателя Госплана СССР, заместителем Предсовмина СССР, а в 1959 году — Председателем Госплана СССР, и в 1960 — членом Президиума (Политбюро) ЦК КПСС и первым замом Предсовмина СССР, то есть самого Хрущёва.

Учитывая то, что "хрущ" был ещё и Первым секретарём ЦК, отдавая много сил борьбе с партийными и чиновными элитами, на хозяйственное управление страной у него времени не оставалось, и Косыгин уже в 1960 году стал фактически премьером страны. При нём проводится денежная реформа 1961 года (Косыгин уже проводил другую при Сталине в 1947 году с отменой карточек). В 1964 году, по случаю 60-летия с подачи Хрущёва Косыгину присваивают первое весьма почётное звание Героя Социалистического труда.

И только после антихрущёвского октябрьского переворота 1964 года, в котором "неблагодарный предатель" Косыгин принял активное участие, и его окончательного возвышения в качестве официального главы правительства и полноправного члена нового главного правящего триумвирата СССР вместе с новым генсеком ЦК Брежневым и новым главой государства Подгорным, зять Косыгина Гвишиани-младший получил, наконец, обратно доступ в высшую советскую государственную элиту.

Штаб первой советской перестройки.

Так получилось, что карьера Косыгина была с самого начала и постоянно связана не просто с общей экономикой, а с той её конкретной частью, которая в СССР всегда принижалась — с потребительской кооперацией, с НЭПом, текстильной и лёгкой промышленностью, производством и торговлей так называемыми товарами народного потребления, повседневного быта людей.

При Сталине и Хрущеве из СССР ударными темпами делали индустриальную, ядерную, космическую и военную супердержаву, невзирая на трудности и потребности населения. Большей частью с помощью бесплатного рабского труда заключённых ГУЛАГа, бесплатного рабского труда колхозников, у которых даже не было паспортов и права выезда с мест постоянного жительства, бесплатной рабочей силы "ударников коммунистического труда" и "стахановцев" всех мастей. При этом бытовые заботы людей всегда отходили на второй план. Народ десятилетиями жил в дерьме, в бараках, но ударными темпами строил призрачный "коммунизм" — "светлое будущее", которое для него никогда не наступало.

Отраслям так называемой группы "А" (тяжелой и военной индустрии, производства средств производства) много десятилетий отдавался экономический и народно-хозяйственный приоритет, а Косыгин занимался группой "Б" — той, которая не интересовала так называемых "государственников" советской империи, зато касалась напрямую повседневной жизни 180–260 миллионов советских людей. И именно по этой красной линии прошёл в дальнейшем принципиальный раздел между Косыгиным и остальными членами брежневского Политбюро.

При всех своих реальных недостатках, Хрущёв во многом откроет советские границы и даст в середине 1950-х годов огромный импульс свободной экономической мысли, критическому переосмыслению застывших экономических теорий, устаревших сталинских моделей и идеологических схем, попыткам перенесения на нашу социалистическую почву лучших достижений мировой научной мысли, в том числе, и в области управления и менеджмента предприятиями и территориями.

В середине своей деятельности Хрущёв, не без активного влияния Косыгина, всё-таки озаботится бытом и нуждами людей, запустит программу массового строительства отдельного жилья из готовых сборных блоков. Это потом его наспех и плохо построенные блочные пятиэтажки (послевоенная проблема жилья стояла так остро, что приходилось жертвовать качеством ради быстроты: реальная жизнь — это всегда компромисс) презрительно окрестят в народе "хрущёбами".

А в конце 1950-х — начале 1960-х годов измотанные десятилетиями лишений советские люди были искренне рады ускоренному расселению из деревянных временных, ещё сталинских бараков и коммуналок, в новые, отдельные, светлые квартиры в блочных домах, без клопов и тараканов. Так родится в северо-западном пригороде Москвы и город-спутник Зеленоград — центр советской электроники, куда в 1964 году переедет семья Сергея Жакова, доставившего в декабре 1980 года столько хлопот КГБ СССР.

Тем более, что "хрущёвки", которым так радовались тогда советские люди, изначально замысливались как временное жильё на 25 лет (лишь на время массового решения острейшей жилищной проблемы в результате послевоенного бума рождаемости), после чего они подлежали сносу и замене на более качественные дома.

Но потом, уже в годы "застоя" при Брежневе и Андропове, этот изначальный посыл о временности "хрущёвок" будет сознательно предан забвению, и они навечно превратятся в символ вечного плохого жилья — в СССР не было ничего постояннее, чем временное. Причем миллионы неблагодарных людей запомнят и будут поминать дурным словом не тех (Брежнева, Суслова, Подгорного, Кириленко, Андропова и пр.), кто извратил и отменил временные, но правильные и неотложные планы Хрущёва, а его самого, кто первый им подарил в своё время бытовые радости и принёс огромное облечение жизненных условий после Сталина.

Прагматик Косыгин, которому всегда были противны звонкие и пустые идеологические лозунги, попытается использовать аппаратное смещение Хрущёва для кардинального изменения политики государства с разворотом его лицом к людям. Так родилась знаменитая косыгинская экономическая реформа 1965 года, с возвращением от показавшей себя неэффективной хрущёвской территориальной системы совнархозов обратно к обновлённым министерствам, где появились функциональные главки.

С отказом от многих старых и душивших экономику показателей (пресловутого "вала" — производства валовой продукции), с новыми идеями социалистического потребительского рынка, хозяйственного расчёта, относительной экономической самостоятельности предприятий, организации производства для получения прибыли с прямым материальным поощрением тружеников и даже конвергенции капитализма и коммунизма — сближения и взаимообмена идеями между двумя способами производства, ранее считавшимися антагонистическими, непримиримыми.

С заимствованием у капитализма самых логических, эффективно работающих и прагматических рыночных идей, призванных улучшить, повысить эффективность жёсткой, неповоротливой, социалистической, плановой и централизованной системы, столкнувшейся с огромными и неразрешимыми экономическими проблемами. Так неосуществимые идеи вечной коммунистической революции сменялись принципами социальной эволюции, постепенных преобразований в обществе.

В этом деле огромной важности Джермен Гвишиани стал самым доверенным лицом премьера-эволюционера Косыгина, его единомышленником, соратником, помощником. Тут оказалось что-то отличавшее Гвишиани от остальных блатных деток номенклатурных папаш и мамаш. Это был редкий случай, когда судьба свела вместе две редко совместимые вещи: власть и талант. И получился качественный прорыв. Фактически в ГКНТ создается штаб перестройки советской человеконенавистнической системы в социализм с "человеческим лицом".

В 1960-х годах кандидат наук, социолог и философ Джермен Гвишиани начинает работать в Госкомитет СССР по новой технике, затем в Государственном комитете СМ СССР по науке и технике (позднее переименованном в ГКНТ СССР), где,