В сентябре 1949 г. Джон Дж. Макклой стал верховным комиссаром США в союзной Германии, что ознаменовало окончание более чем четырехлетнего военного правления Германией союзниками. Этот день также ознаменовал начало конца срока, который доктор Отто Амброс проведет в тюрьме за военные преступления. Вскоре он будет включен в список целей операции "Скрепка".

Амброс, любимый химик Гитлера, находился в тюрьме примерно один год из восьмилетнего срока заключения. 30 июля 1948 г. Амброс был признан виновным в массовых убийствах и рабстве в рамках дела № VI последующего Нюрнбергского процесса, процесса IG Farben, и отправлен в тюрьму Ландсберг, также называемую тюрьмой для военных преступников № 1. Расположенная в тридцати восьми милях к западу от Мюнхена, Ландсберг стала домом для 1526 осужденных нацистских военных преступников. Люди размещались в центральном тюремном бараке в отдельных камерах, а сама тюрьма располагалась на территории , напоминающей школу-интернат , со зданиями XIX века, зелеными парками и величественной католической церковью, отделанной деревянными панелями. В 1924 году здесь в течение восьми месяцев находился в заключении Адольф Гитлер. Именно в тюрьме Ландсберг Гитлер написал "Майн Кампф".

В тюрьме Амброс преподавал "химическую технологию" другим заключенным в рамках программы обучения заключенных. Он писал письма своей матери, в которых писал о том, как все это несправедливо. " Политика - это горькая болезнь , и это гротескно, что я, неполитический человек, должен страдать за то, чего я не делал", - писал он. "Но когда-нибудь все эти страдания прекратятся, и тогда пройдет совсем немного времени, и я забуду всю эту горечь". Девятнадцатилетний сын Амброса, Дитер Амброс, написал от имени своего отца прошение о помиловании. "Мой отец, как Вы знаете, невиновен", - так начиналось одно из писем епископу Теофилу Вурму, протестантскому лидеру, регулярно выступавшему за освобождение военных преступников. "Спасибо за поддержку наших усилий... Мой отец незаконно содержится в тюрьме ." Амброс был образцовым заключенным. Лишь однажды на него было наложено дисциплинарное взыскание : "Заключенный Амброс, Отто, WCPL № 1442, стоял и смотрел в окно на женский прогулочный двор, что противоречит тюремному распорядку", - гласит запись в его тюремном деле.

На Отто Амброса работали многочисленные адвокаты, добивавшиеся его досрочного освобождения. Кроме того, он сам писал прошения, в которых просил мелкие вещи. В 1948 г. он попросил у тюремного совета дополнительную подушку, более мягкую, чем та, что ему предоставлялась. В 1949 году он попросил разрешения держать в камере аккордеон. Каждый год Амброс приходил на осмотр к врачу тюрьмы Ландсберг. Осужденный нацистский военный преступник доктор Оскар Шредер, бывший начальник медицинской службы Люфтваффе, проверял показатели Амброса и составлял ежегодный отчет о его здоровье . До суда над врачами Шредер работал в ВВС армии США в авиамедицинском центре в Гейдельберге, а сейчас отбывал пожизненный срок в Ландсберге. В тюрьме также находились Герман Беккер-Фрайзенг и Вильгельм Бейгльбёк, отбывавшие соответственно двадцатилетний и пятнадцатилетний сроки заключения.

Двенадцать последующих процессов над военными преступниками в Нюрнберге завершились всего за несколько месяцев до того, как Джон Дж. Макклой стал верховным комиссаром Германии. Большинство американцев уже давно потеряли интерес к этим процессам. Большинство немцев не одобряли всю идею суда над военными преступниками, а многие считали, что осужденные были выбраны американскими и британскими победителями и получили в наказание "правосудие победителей" . К концу войны американские оккупационные власти установили, что только в американской зоне 3,6 млн. нацистов подлежали "обвинению" в политических или военных преступлениях. Это огромное число было сокращено до 930 тыс. человек, которые затем прошли через 169 282 процесса денацификации. Более 50 тыс. немцев были осуждены за различные преступления нацистской эпохи, в основном в судах Шпрухкаммерна, а также в военных трибуналах союзников. Большинство осужденных отбывали определенное время в послевоенных лагерях заключения или платили номинальные штрафы. К моменту вступления Макклоя в должность 806 нацистов были приговорены к смертной казни и отправлены в тюрьму Ландсберг, а 486 казней были приведены в исполнение к настоящему времени. К осени 1949 года немецкая пресса стала называть осужденных преступников, содержавшихся в Ландсберге, "так называемыми военнопленными". Это был лишь один из деликатных вопросов, с которым столкнулся комиссар Макклой после прибытия в страну. Другой была операция "Скрепка".

Макклой был сторонником программы нацистских ученых с первых дней ее реализации, еще поздней весной 1945 г., когда он занимал пост помощника военного министра. В то время он также был председателем Координационного комитета "Государство - Война - Флот", что позволило ему принимать первые решения о судьбе программы. Макклой был государственным деятелем и юристом, но он был и экономистом. В период между работой в качестве помощника военного министра и верховного комиссара Германии он был президентом Всемирного банка. Его работа в этом банке пришлась на критический период его ранней истории. В литературе Всемирного банка Макклой упоминается как , "определивший отношения между Банком и Организацией Объединенных Наций, Банком и США". Теперь он вернулся на государственную службу в качестве дипломата, приехав в Германию, чтобы занять место генерала Люциуса Д. Клея, покидающего пост главы ОМГУС. Джон Дж. Макклой был невысоким, пухлым человеком, лысеющим, с бравадой банкира. На публике он почти всегда был одет в строгий костюм. В качестве верховного комиссара он путешествовал по Германии на личном дизельном поезде , принадлежавшем Адольфу Гитлеру . Несмотря на то, что власть официально перешла к новому гражданскому правительству Западной Германии, возглавляемому канцлером Конрадом Аденауэром, Макклой продолжал отвечать за многие аспекты правопорядка в Германии, поскольку Западная Германия вновь становилась суверенным государством. Одной из областей, которая была абсолютно неподсудна канцлеру Аденауэру, были узники Ландсберга. Несколько сотен из этих осужденных военных преступников уже были повешены во дворе Ландсберга. Еще 86 заключенным грозила смерть. Когда Макклой вступил в должность верховного комиссара, риторика вокруг узников Ландсберга достигла апогея. Многие немцы требовали освобождения заключенных.

В ноябре 1949 г. группа немецких юристов, связанных с промышленниками из компании "Фарбен", включая Отто Амброса, попросила о встрече с Джоном Дж. Макклоем в его офисе, расположенном в бывшем здании "ИГ Фарбен" во Франкфурте. Здание IG Farben было захвачено армией США, когда войска вошли во Франкфурт в марте 1945 г., и с тех пор служило домом для армии США и различных американских правительственных организаций. Из окон огромного комплекса - крупнейшего офисного здания в Европе до 1950-х