К концу августа 1938 г. в центральном аппарате НКВД скопилось «альбомов» более чем на 100 тыс. чел.[238] Из регионов поступали жалобы на перегруженность тюрем, дороговизну содержания уже фактически приговоренных к расстрелу заключенных и т. п. Для преодоления такого положения в августе 1938 г. было запрещено оформлять дела в «альбомном порядке». Центральный аппарат НКВД продолжал рассматривать списки, поступившие из регионов. Комиссия НКВД и Прокурора СССР с 28 августа по 5 сентября массово подписывала протоколы по «национальным» операциям, прежде всего по «польской», «немецкой» и «харбинской». За два дня (2 и 5 сентября) по приказу № 00593 «двойка» завизировала 50 протоколов на 12 776 чел. Несмотря на предпринятые меры, «двойка» не успела разобрать все накопленные «альбомы», и к середине сентября передала нерассмотренные списки на места. На втором этапе «харбинской» операции при массовом включении китайцев, корейцев и др. в рамки приказа № 00593 Комиссия НКВД и Прокурора СССР рассмотрела «альбомных» справок на 20 929 чел., т. е. около 43 % от общего числа прошедших по карательной акции. Проведенный анализ «альбомных» справок по «харбинской» операции показал, что Комиссия НКВД и Прокурора СССР в последние дни своей работы рассматривала «альбомы», датированные апрелем – маем 1938 г. Справки, составленные в июне – июле 1938 г., «двойка» вернула в регионы Особым тройкам.

Таким образом, Комиссия НКВД и Прокурора СССР наиболее интенсивно работала с октября 1937 г. по середину января 1938 г., т. е. на первом этапе. С середины января 1938 г. отмечается постепенное сокращение рассмотренных «альбомных» справок, особенно это проявилось в марте – апреле и июне – августе 1938 г. Всплеск активности в мае, вероятнее всего, связан с очередным постановлением Политбюро ЦК ВКП(б) о продлении карательных акций. С новой силой к рассмотрению накопившихся «альбомов» Комиссия НКВД и Прокурора СССР приступает 28 августа 1938 г. За три дня (28 августа, 2 и 5 сентября) «двойка» утвердила приговоры в отношении третьей части репрессированных по «харбинской» операции. Поэтому второй период отличается вялостью в утверждении репрессивных приговоров, летом деятельность Комиссии НКВД и Прокурора СССР фактически останавливается.

С середины сентября 1938 г. начинается последний, третий этап «харбинской» операции, характеризующийся новым порядком осуждения. Согласно приказу № 00606, нерассмотренные «альбомы» возвращались в регионы для их утверждения Особыми тройками. С выходом секретного документа под № 00606 массовые аресты в стране завершаются. Приказ предписывал вновь созданным внесудебным инстанциям рассматривать дела в отношении лиц, задержанных до 1 августа 1938 г. Такая дата была выбрана неслучайно, так как последнее постановление Политбюро ЦК ВПК(б) от 26 мая предписывало завершить репрессии в стране 1 августа[239]. Дела на арестованных после этой даты передавались на рассмотрение судебным органам или Особого совещания при НКВД СССР.

К работе Особые тройки приступили в начале октября, именно к этому времени центральный аппарат НКВД отправил скопившиеся материалы по «национальным» операциям. Количество нерассмотренных «альбомов», вернувшихся из Москвы, определяло интенсивность работы региональных внесудебных органов. Так, в Армянскую ССР было отправлено 319 справок[240], в Грузинскую ССР – 456[241], что предопределило завершение работы Особых троек здесь в октябре 1938 г. В другие регионы было возвращено до нескольких тысяч списков. В Ленинградскую область – около 8 тыс.[242], в Новосибирскую – около 4 тыс.[243], в Алтайский край – около 2 тыс.[244], поэтому «альбомы» здесь разбирали до середины ноября 1938 г. На третьем этапе, согласно данным НКВД СССР, по приказу № 00593 прошло 13 909 чел. (28 %)[245].

Если рассматривать выделенные периоды «харбинской» операции с точки зрения количества расстрельных приговоров, то самым кровавым этапом был первый: доля осужденных на смертную казнь составила около 73 %. С 1938 г. количество расстрельных приговоров уменьшается, на втором и третьем этапах численность приговоренных к ВМН исчислялась 59 %. Наиболее суровые репрессивные решения Комиссия НКВД и Прокурора СССР вынесла в сентябре (100 %), октябре (91 %), ноябре (83 %). Сравнительно мягкие приговоры были вынесены в мае (31 %) и сентябре (53 %) 1938 г. В это время протоколы преимущественно были составлены на иностранцев, в том числе китайцев, корейцев и уйгур.

Масштабные аресты лиц, обвиненных в «японском шпионаже», начинаются с 20 сентября 1937 г. Следуя установке центрального аппарата, территориальные карательные органы ориентировались на трехмесячный срок проведения всех массовых операций. Именно на октябрь – декабрь 1937 г., согласно архивно-следственным делам, приходится пик арестов. Начиная с 10 октября 1937 г. Комиссия НКВД и Прокурора СССР ежедневно утверждала по несколько протоколов по «харбинской» операции. Приказ НКВД СССР обязывал ежедекадно отправлять «альбом» по «харбинской» операции на утверждение Комиссии НКВД и Прокурора СССР. Даже на первом этапе не все регионы могли достичь требуемой от них интенсивности в репрессиях. Так, Армянская ССР предоставила первый «альбом» только летом 1938 г. Винницкая, Донецкая, Полтавская, Николаевская, Вологодская, Кировская, Рязанская области, Карельская, Дагестанская, Кабардино-Балкарская АССР и мн. др. составили только по одному «альбому» на «японских шпионов». ДТО Юго-Донецкой железной дороги предоставил «альбом» на одного человека. Ряду регионов, среди которых Московская, Ленинградская, Читинская, Новосибирская, Челябинская, Свердловская области, на первом этапе удавалось достигать таких показателей. Иногда, особенно в ноябре – декабре, перечисленные территориальные НКВД предоставляли на утверждение «двойки» «альбомы» с периодичностью до двух раз в неделю.

Активизация арестов связана также с выходом постановлений Политбюро ЦК ВКП(б) о продлении репрессий от 31 января 1938 г. и 26 мая 1938 г. К предполагаемым датам окончания массовых операций (1 января, 15 апреля, 1 августа) задержания проходили вяло, однако не прекращались. Связи между динамикой арестов и динамикой вынесения приговоров Комиссией НКВД и Прокурора СССР нет. Так, «альбомные» справки, предоставленные УНКВД по Алтайскому краю летом 1938 г., были составлены преимущественно на лиц, арестованных еще в ноябре 1937 г.[246] По регионам задержания проходили неравномерно. Например, массовые аресты в Дальневосточном крае были организованы в марте 1938 г., в Казахстане, Киргизстане, Узбекистане, Туркменистане – весной – летом 1938 г., в Красноярском крае – с начала января по середину апреля 1938 г.[247], в Читинской области – с сентября по начало января 1937 г.[248], в Сталинградской области – до начала декабря 1937 г.[249] Особенно активно проводили аресты ДТО. Согласно сводке начальника шестого отдела ГУГБ НКВД М.А. Волкова, подготовленной к 27 октября 1937 г. и адресованной Н.И. Ежову, к 20 октября 1937 г. дорожно-транспортными отделами по «харбинской» операции было арестовано 3407 чел.[250] (всего за весь период проведения карательной акции ДТО репрессировали около 7 тыс. чел.).